TFF 3. Lig 3. Grup'un 27. haftasında sahasında Erbaaspor'a 6-2 mağlup olan Akhisarspor, Bölgesel Amatör Lig'e düştü. Yeşil-siyahlılar 2018 yılında Okan Buruk ile Ziraat Türkiye Kupası ve Süper Kupa'yı müzesine götürmüştü.
TFF 3. Lig 3. Grup'ta evinde Merkür Jet Erbaaspor'a 6-2 mağlup olan Akhisarspor, sezonun son haftasını beklemeden ligden düşmeyi garantiledi.
2007-2008 sezonunun sonunda TFF 3. Lig'den 2. Lig'e yükselen ve ardından 2009-2010 sezonu sonunda TFF 1. Lig'e çıkan Akhisarspor, 2011-2012 sezonunda büyük bir başarıyla Süper Lig'e adım attı.
Süper Lig'de 7 sezon aralıksız mücadele eden ve bu süreçte hem Türkiye Kupası'nı hem de TFF Süper Kupa'yı kazanan Manisa ekibi, ayrıca her iki kupada da final oynama başarısı gösterdi. Takım, 2018-2019 sezonunda Avrupa arenasında UEFA Avrupa Ligi'nde yer aldı.
Ancak 2018-2019 sezonu sonunda Süper Lig'e veda eden Akhisarspor, 2019-2020 sezonunda TFF 1. Lig play-off yarı finalinde Fatih Karagümrük'e yenilerek finale yükselme şansını kaybetti.
2020-2021 sezonunda TFF 1. Lig'den düşen takım, bir sonraki sezon TFF 2. Lig'den de düşerek, bu sezon sonunda ise TFF 3. Lig'de mücadele edemeyecek duruma geldi.